MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Crinalium epipsammum PCC 9333 plasmid pCRI9333.04

Total Repeats: 604

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019735	TA	3	6	70	75	50 %	50 %	0 %	0 %	428303617
2	NC_019735	ACA	2	6	168	173	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428303617
3	NC_019735	AAC	2	6	298	303	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428303617
4	NC_019735	AT	3	6	314	319	50 %	50 %	0 %	0 %	428303617
5	NC_019735	CTAA	2	8	330	337	50 %	25 %	0 %	25 %	428303617
6	NC_019735	AACTAA	2	12	362	373	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	428303617
7	NC_019735	A	7	7	372	378	100 %	0 %	0 %	0 %	428303617
8	NC_019735	ATT	2	6	416	421	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428303617
9	NC_019735	ATGT	2	8	492	499	25 %	50 %	25 %	0 %	428303617
10	NC_019735	GAT	2	6	504	509	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428303617
11	NC_019735	GAA	2	6	551	556	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428303617
12	NC_019735	TGTT	2	8	565	572	0 %	75 %	25 %	0 %	428303617
13	NC_019735	TGATGT	2	12	578	589	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	428303617
14	NC_019735	TAA	2	6	611	616	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428303617
15	NC_019735	TAT	2	6	619	624	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428303617
16	NC_019735	TAA	2	6	644	649	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428303617
17	NC_019735	GTG	2	6	776	781	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428303618
18	NC_019735	CAT	2	6	873	878	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428303618
19	NC_019735	AGA	2	6	893	898	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428303618
20	NC_019735	A	6	6	959	964	100 %	0 %	0 %	0 %	428303618
21	NC_019735	CTAA	2	8	2751	2758	50 %	25 %	0 %	25 %	428303619
22	NC_019735	A	7	7	2819	2825	100 %	0 %	0 %	0 %	428303619
23	NC_019735	ATG	2	6	3022	3027	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428303619
24	NC_019735	AATC	2	8	3107	3114	50 %	25 %	0 %	25 %	428303619
25	NC_019735	ATGG	2	8	3192	3199	25 %	25 %	50 %	0 %	428303619
26	NC_019735	TTA	2	6	3255	3260	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428303619
27	NC_019735	GAA	2	6	3285	3290	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428303619
28	NC_019735	CA	3	6	3486	3491	50 %	0 %	0 %	50 %	428303619
29	NC_019735	TTA	2	6	3492	3497	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428303619
30	NC_019735	TCA	2	6	3613	3618	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428303619
31	NC_019735	AAAGA	2	10	3627	3636	80 %	0 %	20 %	0 %	428303619
32	NC_019735	ATA	2	6	3666	3671	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428303619
33	NC_019735	AGC	2	6	3683	3688	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428303619
34	NC_019735	TAT	2	6	3744	3749	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428303619
35	NC_019735	GTT	2	6	3756	3761	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428303619
36	NC_019735	CGC	2	6	3825	3830	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428303619
37	NC_019735	CAGG	2	8	3908	3915	25 %	0 %	50 %	25 %	428303619
38	NC_019735	GAA	2	6	4076	4081	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428303619
39	NC_019735	GCCAA	2	10	4272	4281	40 %	0 %	20 %	40 %	428303619
40	NC_019735	AAG	2	6	4299	4304	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428303619
41	NC_019735	GAA	2	6	4410	4415	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428303619
42	NC_019735	CTT	2	6	5299	5304	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428303620
43	NC_019735	T	6	6	5318	5323	0 %	100 %	0 %	0 %	428303620
44	NC_019735	GGGT	2	8	5338	5345	0 %	25 %	75 %	0 %	428303620
45	NC_019735	GGT	2	6	5375	5380	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428303620
46	NC_019735	TAG	2	6	5418	5423	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428303620
47	NC_019735	A	6	6	5447	5452	100 %	0 %	0 %	0 %	428303620
48	NC_019735	CTC	2	6	5939	5944	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428303621
49	NC_019735	GTT	2	6	5947	5952	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428303621
50	NC_019735	TAC	3	9	6001	6009	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428303621
51	NC_019735	TGA	2	6	6132	6137	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428303621
52	NC_019735	AAC	2	6	6208	6213	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428303621
53	NC_019735	TAAC	2	8	6233	6240	50 %	25 %	0 %	25 %	428303621
54	NC_019735	TAC	2	6	6524	6529	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428303622
55	NC_019735	TATC	2	8	6597	6604	25 %	50 %	0 %	25 %	428303622
56	NC_019735	AAC	2	6	6638	6643	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428303622
57	NC_019735	TGC	2	6	6702	6707	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428303622
58	NC_019735	AC	3	6	6835	6840	50 %	0 %	0 %	50 %	428303622
59	NC_019735	TTTA	2	8	6878	6885	25 %	75 %	0 %	0 %	428303622
60	NC_019735	AAC	2	6	6961	6966	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428303622
61	NC_019735	CCGA	2	8	6988	6995	25 %	0 %	25 %	50 %	428303622
62	NC_019735	GT	3	6	7011	7016	0 %	50 %	50 %	0 %	428303622
63	NC_019735	T	6	6	7024	7029	0 %	100 %	0 %	0 %	428303622
64	NC_019735	GCTGAT	2	12	7068	7079	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	428303622
65	NC_019735	TCA	2	6	7115	7120	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428303622
66	NC_019735	GCA	2	6	7176	7181	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428303622
67	NC_019735	A	7	7	7410	7416	100 %	0 %	0 %	0 %	428303622
68	NC_019735	GAA	2	6	7465	7470	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428303623
69	NC_019735	GCT	3	9	7485	7493	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428303623
70	NC_019735	AGA	2	6	7497	7502	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428303623
71	NC_019735	CTT	2	6	7512	7517	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428303623
72	NC_019735	AGC	2	6	7545	7550	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428303623
73	NC_019735	ATT	2	6	7571	7576	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428303623
74	NC_019735	TTTG	2	8	7601	7608	0 %	75 %	25 %	0 %	428303623
75	NC_019735	CTGAC	2	10	7685	7694	20 %	20 %	20 %	40 %	428303623
76	NC_019735	TTGA	2	8	7741	7748	25 %	50 %	25 %	0 %	428303623
77	NC_019735	TGG	2	6	7969	7974	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428303623
78	NC_019735	GAT	2	6	8116	8121	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428303623
79	NC_019735	ACA	2	6	8168	8173	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428303623
80	NC_019735	AAT	2	6	8233	8238	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428303623
81	NC_019735	GCATCA	2	12	8277	8288	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	428303623
82	NC_019735	GCA	2	6	8386	8391	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428303623
83	NC_019735	GGCA	2	8	8427	8434	25 %	0 %	50 %	25 %	428303623
84	NC_019735	TAA	2	6	8671	8676	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428303624
85	NC_019735	CTT	2	6	8725	8730	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428303624
86	NC_019735	AGC	2	6	8740	8745	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428303624
87	NC_019735	AGT	2	6	8762	8767	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428303624
88	NC_019735	ATG	2	6	8820	8825	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428303624
89	NC_019735	T	7	7	8827	8833	0 %	100 %	0 %	0 %	428303624
90	NC_019735	AAC	2	6	8835	8840	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428303624
91	NC_019735	TAA	2	6	8887	8892	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428303624
92	NC_019735	CAAGT	2	10	8972	8981	40 %	20 %	20 %	20 %	428303624
93	NC_019735	AAG	2	6	8991	8996	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428303624
94	NC_019735	A	6	6	9053	9058	100 %	0 %	0 %	0 %	428303624
95	NC_019735	TGC	2	6	9085	9090	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428303624
96	NC_019735	TGA	2	6	9139	9144	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428303624
97	NC_019735	AGTG	2	8	9599	9606	25 %	25 %	50 %	0 %	428303625
98	NC_019735	GAT	2	6	9702	9707	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428303625
99	NC_019735	TG	3	6	9752	9757	0 %	50 %	50 %	0 %	428303625
100	NC_019735	GTT	2	6	10029	10034	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428303625
101	NC_019735	ATCT	2	8	10183	10190	25 %	50 %	0 %	25 %	428303625
102	NC_019735	ATCG	2	8	10241	10248	25 %	25 %	25 %	25 %	428303625
103	NC_019735	ATTT	2	8	10283	10290	25 %	75 %	0 %	0 %	428303625
104	NC_019735	AAT	2	6	10442	10447	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428303626
105	NC_019735	GCG	2	6	10474	10479	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428303626
106	NC_019735	CAA	2	6	10582	10587	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428303626
107	NC_019735	AC	3	6	10642	10647	50 %	0 %	0 %	50 %	428303626
108	NC_019735	CAA	2	6	10668	10673	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428303626
109	NC_019735	A	6	6	10672	10677	100 %	0 %	0 %	0 %	428303626
110	NC_019735	GGAC	2	8	10727	10734	25 %	0 %	50 %	25 %	428303626
111	NC_019735	ATAA	2	8	10804	10811	75 %	25 %	0 %	0 %	428303626
112	NC_019735	GCT	2	6	10835	10840	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428303626
113	NC_019735	CTG	2	6	10871	10876	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428303626
114	NC_019735	GCA	2	6	10913	10918	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428303626
115	NC_019735	CGC	2	6	10938	10943	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428303626
116	NC_019735	AAG	2	6	11064	11069	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428303626
117	NC_019735	AACAA	2	10	11096	11105	80 %	0 %	0 %	20 %	428303626
118	NC_019735	T	6	6	11106	11111	0 %	100 %	0 %	0 %	428303626
119	NC_019735	GAAA	2	8	11133	11140	75 %	0 %	25 %	0 %	428303626
120	NC_019735	GAA	2	6	11166	11171	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428303627
121	NC_019735	ACA	2	6	11283	11288	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428303627
122	NC_019735	ATG	2	6	11312	11317	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428303627
123	NC_019735	GGA	2	6	11386	11391	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428303627
124	NC_019735	AGC	2	6	11429	11434	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428303627
125	NC_019735	TTG	2	6	11498	11503	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428303627
126	NC_019735	CCA	2	6	11572	11577	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428303627
127	NC_019735	GGTA	2	8	11677	11684	25 %	25 %	50 %	0 %	428303627
128	NC_019735	CAT	2	6	11728	11733	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428303627
129	NC_019735	AAT	2	6	11822	11827	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428303627
130	NC_019735	TAA	2	6	11833	11838	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428303627
131	NC_019735	CTC	2	6	12018	12023	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428303628
132	NC_019735	AC	3	6	12111	12116	50 %	0 %	0 %	50 %	428303628
133	NC_019735	CTGC	2	8	12138	12145	0 %	25 %	25 %	50 %	428303628
134	NC_019735	ATC	2	6	12241	12246	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428303628
135	NC_019735	TGC	2	6	12311	12316	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428303628
136	NC_019735	CGG	2	6	12334	12339	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428303628
137	NC_019735	CAAT	2	8	12483	12490	50 %	25 %	0 %	25 %	428303628
138	NC_019735	ATG	2	6	12523	12528	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428303628
139	NC_019735	AGC	2	6	12559	12564	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428303628
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141	NC_019735	CTT	2	6	12917	12922	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428303629
142	NC_019735	TCT	2	6	12949	12954	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428303629
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146	NC_019735	ATA	2	6	13076	13081	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428303629
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154	NC_019735	TGTT	2	8	13410	13417	0 %	75 %	25 %	0 %	428303629
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156	NC_019735	ATT	2	6	13591	13596	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428303629
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248	NC_019735	ATA	2	6	19813	19818	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428303635
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251	NC_019735	T	6	6	20108	20113	0 %	100 %	0 %	0 %	428303636
252	NC_019735	CTTTG	2	10	20134	20143	0 %	60 %	20 %	20 %	428303636
253	NC_019735	ACG	2	6	20147	20152	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428303636
254	NC_019735	GT	3	6	20153	20158	0 %	50 %	50 %	0 %	428303636
255	NC_019735	GT	3	6	20160	20165	0 %	50 %	50 %	0 %	428303636
256	NC_019735	GTA	2	6	20169	20174	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428303636
257	NC_019735	CTTT	2	8	20233	20240	0 %	75 %	0 %	25 %	428303636
258	NC_019735	TTA	2	6	20277	20282	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428303636
259	NC_019735	TAC	2	6	20300	20305	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428303636
260	NC_019735	CTA	2	6	20322	20327	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428303636
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385	NC_019735	CAAAT	2	10	28312	28321	60 %	20 %	0 %	20 %	428303645
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